通過危害分析和預(yù)防措施確定了關(guān)鍵控制點(diǎn)（CCP），為每個(gè)CCP建立關(guān)鍵限值和操作限值后，接下來需要建立文件化的監(jiān)控程序，對每個(gè)CCP點(diǎn)對應(yīng)的關(guān)鍵限值和操作限值進(jìn)行定期的測量或觀察，以評估一個(gè)CCP是否受控，根據(jù)監(jiān)控值的變化趨勢，及時(shí)采取相應(yīng)措施，如加工調(diào)整或采取糾正措施。監(jiān)控對象、監(jiān)控方法、監(jiān)控頻率以及監(jiān)控人員構(gòu)成了監(jiān)控程序的內(nèi)容。

    在監(jiān)控程序中要規(guī)定控制的目標(biāo)，也就是監(jiān)控對象，例如：當(dāng)對溫度敏感成份是關(guān)鍵時(shí)，則對溫度進(jìn)行測定；當(dāng)酸化是食品生產(chǎn)的關(guān)鍵時(shí)，則測量酸性成份的PH值；當(dāng)加熱或冷卻過程是關(guān)鍵時(shí)，則溫度和傳送速度為監(jiān)控對象。監(jiān)控對象可以包括觀察對一個(gè)CCP的預(yù)防措施是否實(shí)施。例如：檢查原料供應(yīng)商的許可證；檢查軟體貝類原料容器上的標(biāo)簽所記的捕撈海域，確定是否來自未批準(zhǔn)的捕撈區(qū)域等。

    在監(jiān)控方法中，要規(guī)定為達(dá)到控制目標(biāo)所使用的方法以及儀器設(shè)備。監(jiān)控必須提供快速的或即時(shí)的結(jié)果。微生物檢測因耗時(shí)長且不宜掌握，因此很少用于CCP監(jiān)控；物理和化學(xué)的測量手段快速、方便，是較理想的監(jiān)控方法，如對時(shí)間／溫度、水分活度（aw）、酸度（PH）、感官檢查等的監(jiān)控都是常用的監(jiān)控方法。

    在監(jiān)控程序中，除了規(guī)定合適的監(jiān)控方法外，還必須考慮選擇何種監(jiān)控儀器、設(shè)備。根據(jù)不同的監(jiān)控對象，可選用不同的監(jiān)控儀器、設(shè)備，如溫度計(jì)、自動(dòng)溫度記錄儀、鐘表、衡量器、PH值計(jì)、水活度計(jì)和化學(xué)分析設(shè)備等。設(shè)備必須準(zhǔn)確、可靠。例如，某產(chǎn)品的最低中心溫度必須達(dá)到63℃方可殺滅致病菌，而溫度計(jì)的誤差為±１℃，那么，CL值就設(shè)定為64℃。另外，溫度計(jì)需定期校正，以確保準(zhǔn)確性。

    在監(jiān)控程序中應(yīng)規(guī)定監(jiān)控頻率。監(jiān)控可以是連續(xù)的，也可是非連續(xù)的。但監(jiān)控頻率必須能確保對CCP進(jìn)行有效監(jiān)控，只要有可能，盡量采用連續(xù)監(jiān)控，連續(xù)監(jiān)控對很多種物理和化學(xué)參數(shù)是可行的。例如，采用溫度記錄儀可以對蟹肉巴氏殺菌全過程的溫度／時(shí)間實(shí)現(xiàn)監(jiān)控和記錄；采用金屬探測器對產(chǎn)品進(jìn)行金屬雜質(zhì)的連續(xù)監(jiān)控等。

    監(jiān)控儀器、設(shè)備可以產(chǎn)生連續(xù)的監(jiān)控記錄，但并不意味著已經(jīng)對危害實(shí)行了控制。定期檢查連續(xù)監(jiān)控記錄，必要時(shí)采取措施，這也是監(jiān)控的一個(gè)組成部分。當(dāng)出現(xiàn)CL偏離時(shí)，檢查間隔的時(shí)間長短將直接影響到產(chǎn)品返工和損失的數(shù)量，因此，監(jiān)控頻率必須有利于產(chǎn)品的標(biāo)識(shí)和可追溯性。
當(dāng)不可能連續(xù)監(jiān)控一個(gè)CCP時(shí)，例如，罐內(nèi)最大裝罐量、初溫的監(jiān)控等，縮短監(jiān)控的時(shí)間間隔，對監(jiān)控可能發(fā)生的關(guān)鍵限值和操作限值的偏離是很有效的一種手段。

    制定HACCP計(jì)劃時(shí)，明確由誰監(jiān)控以及監(jiān)控責(zé)任是另一個(gè)重要的考慮因素。從事CCP監(jiān)控的人員可以是：流水線上的人員、設(shè)備操作者、監(jiān)督員、維修人員或質(zhì)量保證人員。作業(yè)的現(xiàn)場人員進(jìn)行監(jiān)控是比較合適的，因?yàn)檫@些人在連續(xù)觀察產(chǎn)品的生產(chǎn)和設(shè)備的動(dòng)作中，能容易地發(fā)現(xiàn)異常情況的發(fā)生。同時(shí)，HACCP活動(dòng)中有現(xiàn)場人員參與，有利于HACCP計(jì)劃的理解和執(zhí)行。CCP監(jiān)控人員必須：（1）受過CCP監(jiān)控技術(shù)的培訓(xùn)；（2）充分理解CCP監(jiān)控的重要性；（3）在監(jiān)控的方便崗位上作業(yè)；（4）能對監(jiān)控活動(dòng)提供準(zhǔn)確報(bào)告；（5）能及時(shí)報(bào)告CL值偏離情況，以便迅速采取糾正措施。

    監(jiān)控人員的責(zé)任是及時(shí)記錄監(jiān)控結(jié)果，報(bào)告異常事件和CL值偏離情況，以便采取加工過程調(diào)整或糾正措施。所有CCP的有關(guān)記錄必須有監(jiān)控人員的簽名。

    另外，在監(jiān)控程序中應(yīng)規(guī)定審核負(fù)責(zé)人，審核人員負(fù)責(zé)對監(jiān)控記錄進(jìn)行審核，并在審核記錄上簽字。監(jiān)控記錄必須予以保存，它可以用來證明產(chǎn)品是在符合HACCP計(jì)劃要求的條件下生產(chǎn)的，同時(shí)，為將來的驗(yàn)證提供必需的資料。